Terrorgruppen Haqqani Network begynte å vises i rapportene fra etterretningsbyråer som opererer i Afghanistan og Pakistan fra 2004-2005. Navnet på nettverket er assosiert med navnet på feltkommandøren Jalaluddin Haqqani, som kjempet mot de sovjetiske troppene.
Under oppholdet til sovjetiske tropper i Afghanistan var Jalaluddin Haqqani en berømt feltkommandør, han ble støttet av US Central Intelligence Agency, og ga økonomisk hjelp.
Etter tilbaketrekningen av sovjetiske tropper fortsatte borgerkrigen i Afghanistan. Haqqani har vært involvert i flere store operasjoner, hans autoritet har vokst betydelig. I 1992 deltok han i fredsforhandlinger mellom de stridende partiene, ble deretter justisminister i Afghanistan og hadde denne stillingen i fire år.
Etter at Taliban ble tatt til fange av Kabul i 1996, hoppet Haqqani over til deres side og ble utnevnt til minister for grensesaker. I praksis førte dette til at han fullstendig kontrollerte provinsen Paktia, som huset al-Qaida treningsleirer som senere ble ødelagt av amerikanerne. Etter starten på den amerikanske operasjonen mot Taliban begynte Haqqani å befale sine væpnede styrker, men kunne ikke motstå inntrengerne. Taliban ble beseiret, Haqqani begynte å føre en geriljakrig og ble snart kåret av amerikanerne som en av de seks mest etterlyste terroristene til Taliban.
Haqqanis handlinger mot regjeringsstyrker og den amerikanske hæren var svært vellykkede, siden midten av 2000-tallet begynte rapporter fra Afghanistan å nevne "Haqqani Network", som indikerte økt innflytelse fra denne krigsherren. Siden 2006, sammen med Haqqani, har sønnen Sirajuddin (Siraj) hatt ansvaret for nettverket. Siden 2007 var det Siraj som styrte gruppen i forbindelse med farens forverrede helse. Tett tilknyttet Taliban, opererte terroristgruppen Haqqani likevel uavhengig og underkastet seg aldri noen.
Snart inkluderte ledelsen i "Haqqani Network" allerede flere familiemedlemmer til grunnleggeren og en rekke feltkommandører, gruppen kontrollerte flere provinser i Afghanistan. Siden 2008 begynte gruppen å bruke selvmordsbombere for å gjennomføre terrorangrep. De amerikanske myndighetene begynte å se på den som den største trusselen mot amerikanske tropper i Afghanistan. Ifølge etterretningstjenestene varierte antall medlemmer av nettverket i 2010 fra 4 til 15 tusen mennesker. Det var vanskelig å estimere antall militante mer nøyaktig på grunn av gruppens lukkede natur.
Siden 2008 har sønnen til gruppens grunnlegger, Siraj Haqqani, blitt inkludert av USA på listen over terrorister; siden 2009 er det blitt kunngjort en belønning på 5 millioner dollar for informasjon om ham. De neste årene ble Nasiruddin Haqqani, Khalil al-Rahman Haqqani og Badruddin Haqqani lagt til på terrorlisten.
I lang tid turte ikke amerikanske myndigheter offisielt å inkludere "Haqqani Network" i antall terrorgrupper, ettersom de fremdeles håpet å komme til enighet med lederne for en slik innflytelsesrik bevegelse. Landets etterretningstjenester holdt til og med møter med representanter for nettverket, men de klarte ikke å komme til noen avtaler.
Situasjonen ble endelig oppklart i september 2011, da terrorister fra Haqqani-nettverket angrep NATOs styrkesteder og den amerikanske ambassaden i Kabul. 16 personer ble ofre for angrepet. Det ble klart at det ikke ville være mulig å komme til enighet med terroristene, og i september 2012 ble det kunngjort at USA hadde lagt Haqqani-nettverket til listen over terrorgrupper.
